archives Articles

  • Parsing the Evolution of Language (Letter)

    Atkinson, Q.D., Meade, A., Venditti, C., Greenhill, S.J., & Pagel, M. Parsing the Evolution of Language (Letter). Science 320 (5875), 446a.

    continue Continue...

  • Talk: Horizontal Transmission and Cultural Phylogenies

    I'll be talking at the NZ Phylogenetics Meeting this week on Horizontal transmission and cultural phylogenies: Phylogenetic tree thinking is beginning to revolutionise studies of linguistic and cultural evolution. However, linguistic and cultural traits are easily transmitted horizontally ("borrowed") between cultures. Indeed, well over 95% of the words in the Oxford English Dictionary aren't English. A loud and persistent debate has centered around the issue of borrowing and whether it invalidates cultural phylogenies or not. Here, we use a natural model of linguistic evolution to simulate borrowing between languages. The results show that tree topologies constructed with Bayesian phylogenetic methods are relatively robust to the effects of realistic levels of borrowing. Inferences about time depth are slightly less robust.

    continue Continue...

  • Languages evolve in punctuational bursts

    Atkinson, Q. D., Meade, A., Venditti, C., Greenhill, S. J., & Pagel, M. (2008) Languages evolve in punctuational bursts. Science, 319, 588.

    continue Continue...

  • The Pleasures and Perils of Darwinizing Culture (with phylogenies)

    Gray, R. D., Greenhill, S. J., & Ross, R. M. (2007). The Pleasures and Perils of Darwinizing Culture (with phylogenies). Biological Theory, 2(4).

    continue Continue...

  • The Austronesian Basic Vocabulary Database

    Greenhill, S. J., Blust. R, & Gray, R.D. (2005-2007) The Austronesian Basic Vocabulary Database. http://language.psy.auckland.ac.nz/austronesian

    continue Continue...

  • COOL7 - Language trees and the des langues et base de données du vocabulaire austronésien

    Nombre de données linguistiques essentielles recueillies au fil des ans dorment dans des placards et ne sont pas accessibles à la communauté linguistique ou au public intéressé. Nous (Gray & Greenhill) exploitons ces données pour reconstruire des arbres phylogénétiques des langues à l'aide des méthodes informatiques utilisées en biologie de l'évolution et pour vérifier ainsi les hypothèses émises sur le peuplement du Pacifique. Dans cette optique, nous avons informatisé une grande quantité de données lexicales et construit une base de données à grande échelle. Nous avons débuté avec le vocabulaire fourni par les listes de Swadesh rassemblées par Blust ces dernières vingt années ; notre base s'est ensuite enrichie grâce aux données de nombreux linguistes ou de publications. On peut consulter la base de données de vocabulaire austronésien (Austronesian Basic Vocabulary Database) à l'adresse suivante: http://language.psy.auckland.ac.nz. Actuellement, cette base concerne 481 langues, pour un total de plus de 100 000 entrées. Nous présenterons quelques-unes des techniques requises pour construire une telle base et nous évoquerons l'intéret qu'il y a à mettre à disposition sur internet ces données pour des recherches en collaboration. Pour terminer, nous exposerons nos projets d’extension et de consolidation de cette base de données, en invitant les chercheurs à nous fournir de nouvelles données. Au cours de notre communication, nous mentionnerons quelques résultats issus de nos dernières analyses.

    continue Continue...

  • Simple webserver file alteration monitoring using integrit

    This shows us once again, that any software you run on your website needs to be kept up-to-date immediately, but what shocked me was that so many people out there running websites and are not watching them for file changes. They had no idea that their sites had been hacked until they went and looked for it.

    continue Continue...

  • Doom 2007 - Pacific settlement and Austronesian languages.

    The settlement of the Pacific is one of the greatest population movements in the last 10,000 years, and lead to the settlement of the region bounded by Taiwan, Hawaii, Easter Island (Rapanui), New Zealand, and Madagascar. This Austronesian expansion brought with it (and developed along the way) a distinctive Lapita cultural complex and what has become the largest language family in the world, with over 1,000 languages. There are a number of scenarios describing this Austronesian expansion as either a rapid tree-like spread from Taiwan beginning around 6000 BP, or expansion from a deeper Island South-East Asia origin around 13,000 BP. Over the last few years we have built a large comparative database of linguistic information from these languages (Austronesian Basic Vocabulary Database) and have begun using phylogenetic methods on it.

    continue Continue...

  • Query PubMed for citation information using a DOI and Python

    Here's a simple little script to query PubMed for a Digitial Object Identifier (a DOI)

    continue Continue...

  • Simple FAQ application for Django

    This is an exceedingly simple FAQ application for Django, which I wrote for Henry.

    continue Continue...